MPICH2 클러스터링 설정하기
MPICH2 공식사이트 가기 Ubuntu 사이트 문서 다음 내용은 우분투 사이트에 있는 문서를 참조해서 정리한 내용이다. 헤드노드는 다음 패키지를 추가한다. nfs-kernel-server build-essential 간단한 구축 과정은 다음과 같다. 모든 노드에 우분투 서버를 설치하고 최신 패키지로 업데이트 한다. 다음 패키지를 추가로 설치한다. nfs-kernel-server build-essential 모든 노드에 /etc/hosts 파일에 노드를 등록한다. ex) 192.168.133.100 ub0 192.168.133.101 ub1 192.168.133.102 ub2 192.168.133.103 ub3 헤드 노드에서 다음과 같이 작업한다. 1. NFS로 공유할 디렉터리를 생성한다. # mkdir /mirror 2. 공용으로 사용할 사용자 계정을 생성한다. # adduser --home /mirror/mpiu --uid 1001 mpiu 3. mpiu 계정에 SSH 접속시 암호를 묻지 않도록 하기 위하여 키를 생성한다. $ ssh-keygen -t rsa $ cat id_rsa.pub >> authorized_keys RHEL을 사용할 경우 공개키를 다음과 같이 접속하고자 하는 서버에 복사할 수 있다. $ ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub 서버 4. NFS 서버를 설정한다. /etc/exportfs 파일에 /mirror 디렉터리를 추가한다. /mirror *(rw,sync) 5. MPICH2 를 소스로 받아서 설치한다. $ ./configure --prefix=/mirror/mpich2 $ make $ sudo make install mpiu 계정을 다음과 같이 설정한다. 1. .bashrc 파일에 다음을 추가한다. export PATH=/mirror/mpich2/bin:$PATH export LD_LIBRARY_PATH=/mirror/mpich2/lib:$LD_LIBRARY_PATH 2. mpd.ho...